génotype

Un peu d’histoire

Comme nous le savons aujourd’hui, Gregor Mendel, connu surtout pour ses expériences avec les pois, a été à la base de la génétique. Il a démontré par ses expériences que s’il croisait deux pois (F1) ayant des caractéristiques différentes comme la couleur de la fleur, la taille des feuilles… Alors les issus (F2) gardaient les caractéristiques d’un seul parent. Toutes les fleurs de ces jeunes pois avaient la même couleur et la même taille de feuilles.
C’est comme s’ils avaient «perdu» l’une des propriétés. Lorsqu’il a croisé entre eux ces jeunes pois F2, les caractéristiques F1 sont réapparues parmi les issus de la génération F3. Mendel a appelé ces caractéristiques montrées par les F2 : Dominant. Et les caractéristiques cachées chez les F2 ont été nommées récessif.

Actuellement nous appelons encore cela dominant et récessif. Cependant nous savons que Mendel a découvert la «dominance complète». Il existe en effet d’autres formes de dominance. Nous connaissons déjà ces formes donc nous apporterons surtout quelques dispositions à retenir.

Quelques concepts

Nous savons que les gènes sont porteurs de caractéristiques et que ces gènes sont situés sur les chromosomes. Il existe des gènes s’occupant de la couleur des yeux, la couleur des pattes, la taille du bec… Les chromosomes se situent dans les cellules du corps : Ils sont stockés dans le noyau de chaque cellule. Dans chaque noyau de chaque cellule se trouvent les gènes pour la couleur des yeux, la couleur des pattes, la taille du bec... Cependant, le fonctionnement des gènes «couleur des yeux» se manifeste uniquement dans les yeux. Dans les pattes, les gènes «couleur des yeux» ne se manifestent pas. Chaque cellule «sait» donc où elle se situe dans le corps et quels gènes elle doit activer.
Les chromosomes vont par paire, tous les gènes se retrouvent par paire. Pour le gène de la couleur des yeux, nous avons donc deux gènes. Ceci vaut également pour la couleur des pattes, la taille du bec... Ces deux gènes pour la couleur des yeux peuvent provoquer une couleur des yeux bleues. Il est également possible qu’un gène s’occupe de la couleur bleue et l’autre d’une couleur brune. (ce qui ne signifie pas que l’être aura un œil bleu et l’autre brun, le brun des yeux est dominant sur le bleu, donc les deux yeux seront bruns).

Pourquoi les mutations chez le diamant mandarin que sont le dos pâle, le masqué (nouveau type) et le masqué ancien type combinées entre elles sont si difficiles à prédire !?
Tous simplement car on ne peut pas parler au niveau génétique de mutations différentes mais plutôt de versions alléliques d'un seul et même gène. Le dos pale, le masqué et le masque AT sont dû à un même gène mais qui a trois versions alléliques.
Pour bien comprendre faisons la parallèle avec l'homme, la couleur des yeux par exemple, quelque soit notre couleur des yeux, notre couleur de l'iris et codé par le même gène, mais ce gêne possède de nombreuse versions différentes (allèles) qui nous permettent d'avoir le panel de couleur que nous connaissons.

Maintenant que nous savons un peu plus ce qui complique ces croisements, voyons comment chaque allèle se comporte l'un par rapport à l'autre.
Tout est une histoire de dominance et de codominance ou récessivité.

Un petit tableau pour illustrer tout cela :

*AT = ancien type

Dans ce tableau à double entrée vous pouvez voir qu'elle allèle domine l'autre, l’oiseau aura donc le phénotype de l'allèle qui domine, attention ce n'est pas parce que l'allèle est dominé qu'il n'influe pas. Cf. dos pale/masque AT, le dos est plus dilué à cause de l'allèle masqué AT.

De ce résultat nous pouvons en tirer les premières conclusions :

• Le dos pale peut être porteur de masqué ou de masqué AT.
• Le masqué peut être porteur de masqué AT mais ne peut pas être porteur de dos pale (dp domine masqué = dp/masqué).*dp = dos pâle
• Le masqué AT ne peut pas être porteur de dos pale, ni de masqué car ces deux derniers le dominent.

Petit logiciel pratique permettant d'avoir les probabilités des résultats d'un accouplement suivant la ou les mutations des parents respectif. Il peut être mis sur clés USB, nul besoin d'une connexion internet pour l'utiliser.

Avant cela, il faudra évidement connaître le génotype de chaque parent. Pour vous aidez à déterminer la mutation ou combinaison de mutations à laquelle appartiennent vos diamants mandarins, vous pouvez vous reportez au : Glossaire illustré des mutations chez le diamant mandarin.
Cela dit, je dirai que ce logiciel n'est qu'une aide. Le mieux sera toujours d'appréhender le mode de transmission de chaque mutation. Pour cela, Je vous conseille aussi pour avoir une bonne base de consulter l'article : Génétique du diamant mandarin : Mode d'emploi.
 

Voici un site, aussi disponible en application, dédié au calcul de la génétique des diamants mandarins. ZebraCalc vous permet d'avoir les probabilités des résultats suivant la ou les mutations des parents respectif.

Avant cela, il faudra évidement connaître le génotype de chaque parent. Pour vous aidez à déterminer la mutation ou combinaison de mutations à laquelle appartiennent vos diamants mandarins, vous pouvez vous reportez au : Glossaire illustré des mutations chez le diamant mandarin.
Cela dit, je dirai que cette application n'est qu'une aide. Le mieux sera toujours d'appréhender le mode de transmission de chaque mutation. Pour cela, Je vous conseille aussi pour avoir une bonne base de consulter l'article : Génétique du diamant mandarin : Mode d'emploi.

C’est en 1960 que sont apparus en Belgique les premiers diamants mandarins dos pâles bruns.
Essayons de comprendre comment a pu naître une telle combinaison de couleurs.

On sait que les facteurs brun et dos pâle, liés au sexe, sont situés sur des chromosomes X, mais différents et à des emplacements (loci) différents : (1) et (2).
Ils ne sont donc, normalement pas liés (sinon tous les bruns seraient aussi dos pâles : ce qui n’est pas le cas).
Comment ont-ils pu se trouver liés sur le même chromosome ? (3)



Quand on accouple un mâle brun avec une femelle dos pâle gris (ou l’inverse), on obtient à chaque fois des mâles gris, porteurs de brun et de dos pâle. Chaque mâle possède donc deux chromosomes X différents : L’un porte les gènes « brun » « non dos pâle », l’autre porte les gènes « non brun » et « dos pâle ». Étant récessifs, aucun de ces gènes ne peut s’exprimer puisqu’il est en un seul exemplaire ; étant non-allèles, aucun ne peut dominer l’autre ; c’est donc une couleur grise naturelle qui s’exprime.

Comment ces gènes vont-ils être transmis par le mâle à sa descendance ? Pour bien le comprendre, quelques explications sont nécessaires.

Les chromosomes sont de très longues molécules (2 millionièmes de mm d’épaisseur, 5 cm de moyenne de longueur chez l’homme) enchevêtrées, en temps normal, les unes aux autres dans le noyau de la cellule. Au moment de la méiose (division cellulaire permettant, chez les mâles, la formation des spermatozoïdes à partir des cellules-mères des testicules), ces chromosomes se dédoublent en deux chromatides rigoureusement identiques rattachées entre elles par un centromère.
Chaque chromatide s’enroule alors en spirale. Ce n’est qu’à ce moment là que le chromosome devient visible au microscope optique. Les chromosomes se regroupent et s’accolent deux à deux par paire homologues.

Au cours de cette phase, deux chromatides des deux chromosomes accolés peuvent se croiser, se casser puis se ressouder en échangeant des segments plus ou moins importants. C’est ce phénomène que l’on appelle l’enjambement (en anglais crossing-over).
Le gène « brun » a ainsi pu se retrouver lié au gène « dos pâle » sur le même chromosome X. Un mâle gris porteur de brun et de dos pâle peut (mais uniquement de cette façon) produire des femelles dos pâles gris, grises, brunes et dos pâles brun. (12,5% de chaque).

Avec cet enjambement, ce même mâle a pu avoir aussi :

• Croisé avec une femelle dos pâle : 12,5% de mâles dos pâle gris porteurs de brun.
• Croisé avec une femelle brune : 12,5% de mâle bruns porteurs de dos pâle.

En accouplant l’un ou l’autre de ces derniers avec leur sœur « dos pâle brun », il est possible d’obtenir (en 3ᵉ génération) : 25% de mâles dos pâle brun et 25% de femelles dos pâle brun.



CHROMATIDE

A : Normale
B : Contractée en spirale
C : Schématisée

Si on pose lors d'une réunion d'amateurs de diamants mandarins une question sur la généalogie du masqué, du pastel, ou d'un joues noires, on est certain de recevoir la bonne réponse.
Mais si on pose la question sur la généalogie sur le format (taille), la forme de la tête ou la longueur du bec, les réponses seront multiples et différentes.
Certains diront intermédiaires, d'autres dominants, etc.

Néanmoins ces caractéristiques suivent les Lois de Mendel. Beaucoup d'éleveur ne croient pas cette explication, mais elle est vraie. Il semble que les lois ne se comportent plus d'une façon stricte comme pour les mutations de couleurs. Une variation plus large au niveau du format (taille), forme de la tête, etc. semble normal.



Dans la nature, on trouve chez les diamants mandarins la même variation dans le format. Et, dans le processus de domestication, cette différence dans la variation a augmenté. Nos diamants mandarins cultivés sont en moyenne deux centimètres plus larges que leurs ancêtres dans la nature.
Dans les articles, on préconise toujours une sélection dure au niveau du format et du modèle en tenant compte des différences entre les parties comme la tête, le corps, etc.

Mais le format et le modèle sont dirigés par la généalogie. Les formes du corps sont dirigées par des facteurs.
La question qui se pose est : Existe-t-il une relation entre les différents facteurs qui dirige le format, le modèle, la forme de la tête et du bec ?

L’objectif de cet article n’est pas d'établir une règle imparable pour la reconnaissance d'un mâle gris porteur de la mutation poitrine noire. Il a plutôt pour but de réunir les indices qui pourront vous permettre de l'identifier.
Pour ceci, chaque point de détail de la mutation est repris, selon ce que j’ai pu observer durant la sélection de ma souche de gris poitrine noire.

Avant de commencer à analyser chaque indice possible, il me paraît important d'avoir à l'esprit que la mutation poitrine noire modifie la forme des dessins. Pour identifier un porteur de la mutation poitrine noire, je vous conseille aussi de prendre en compte l’ensemble des indices décrits dans cet article.

Procédons et analysons le phénotype d’un gris poitrine noire de la tête vers les rectrices en comparaison avec un gris porteur de la mutation poitrine noire. Pour repérer chaque termes descriptifs utilisés, vous pouvez vous aidez de ce schéma : Termes descriptifs chez le diamant mandarin.

1. Trait moustachial

Poitrine noire (pn) : Le trait moustachial sera prononcé et d’un noir intense.
Porteur poitrine noire (/pn) : Le trait moustachial pourra être plus prononcé que sur un gris, cependant cela ne constitue pour moi pas un indice suffisant.

2. Trait de larme

Poitrine noire (pn) : Le trait de larme disparaît (idéalement suivant le standard) ou seul un trait fin subsiste.



Porteur poitrine noire (/pn) : Différents cas de figure selon la force d’expression de la mutation chez le porteur.

- Le trait de larme est présent et fin :



- Le trait de larme est présent et large :



- Dans certains cas le trait de larme d’un porteur de poitrine noire pourra aussi être absent. Il faudra se fier aux autres indices pour savoir s’il s’agit d’un porteur ou d’un poitrine noire à part entière.

3. Les joues

Poitrine noire (pn) : Le dessin des joues s’étendra vers le haut et l’arrière de la tête.


 

J'ai réalisé ce glossaire pour illustrer en photos les mutations existantes chez le diamant mandarin.
Il pourra vous aidez à identifier la ou les mutations de vos diamants mandarins.

Précision importante : Pour identifier le génotype de votre diamant mandarin, il faudra prendre en compte qu'un diamant mandarin peut être porteur d'une mutation sans être mutant.
Être porteur (/) d'une mutation signifie que celle-ci est présente partiellement (génétiquement parlant). Du point de vue visuel la mutation partiellement portée ne se verra pas ou seulement par quelques indices présents dans l'apparence de l'oiseau.
Il faudra dans ce cas, avoir un œil averti pour déterminer le génotype. Parfois des accouplements de vérification seront nécessaires.
Votre diamant mandarin peut aussi avoir plusieurs mutations, les combinaisons possibles sont nombreuses.

Ce glossaire se base uniquement sur le phénotype (caractères visuels) et mutations simples (non combinées).

Gris (GR)

Le diamant mandarin gris n'est pas une mutation, il s'agit du type original (sauvage).



1. Mutations liées aux sexes

La femelle ne peut jamais être porteuse, elle est donc mutante ou non mutante.
Le mâle peut être porteur de la mutation.

Brun (Br)
 

1. Définir ses objectifs

Tout d'abord, il faut selon moi cibler et cerner ses objectifs : Choix de ou des mutations à sélectionner, études des caractéristiques de ou des mutation(s) choisie(s), connaissance du type de transmission génétique, se créer un réseau d'éleveur susceptible de travailler sur des objectifs similaires pour avoir des sujets de départs. Les éleveurs devront avoir confiance en votre projet et votre perspicacité. Ils seront également soucieux du devenir de leurs oiseaux cédés.
Conditions indispensables pour ensuite commencer la construction d'une souche et débuter une sélection afin de tendre vers vos objectifs définis comme tout projet.

Enfin, définissez votre idée de l'oiseau que vous souhaitez obtenir. Sans oublier les caractéristiques de la mutation ou combinaison dans laquelle ou lesquelles vous vous projetez.

2. Conseils pour débuter

Choisissez les diamants mandarins de départ avec le moins de défauts possibles. Assurez-vous surtout de ne pas commencer avec des oiseaux ayant un génotype incertain.
Exemple : Si vous avez comme projet de construire une souche de gris, vérifiez s'ils ne seraient pas porteur de mutation à hérédité récessive (comme poitrine noire, joues noires).

Questionnez l'éleveur vous cédant vos premiers spécimens, demandez à voir les parents pour être mieux fixé. Observez les différentes qualités et points à améliorer de chacun en ayant en tête le diamant mandarin que vous souhaitez atteindre.
Observez l’harmonie et l'ensemble des oiseaux de l’éleveur, une homogénéité vous fera apparaître un bon travail de l’éleveur.

3. Qu'est-ce qu'une souche

Il faut se représenter la souche d'un arbre, son tronc et ses branches. Composés d'ascendants, de descendants, sœurs, frères, etc. Différentes méthodes existent selon le type de transmission génétique de la mutation ou combinaison élevé pour faire progresser une souche.